А давайте разберемся почему ЮЛ может не попасть в РМСП:
1) Не подходит ОПФ;
2) Это ООО, но у него в качестве учредителя (участника) - органы госвласти или местного самоуправления с долей больше, чем можно по закону
3) Это ООО, но у него учредитель - иностранное ЮЛ с долей больше, чем разрешено по закону о МСП (с января еще добавятся и учредители (участники) - российские ЮЛ)
4) нет отчетности о доходах за прошлый год или доход больше определенной величины;
5) нет отчетности о численности за прошлый год или она больше определенной величины.
Если говорить о первых 3-х факторах - то это данные ЕГРЮЛ. Последние - это данные, поднятые из НО по месту постановки на учет.
В любом случае, заявление, поданное с признаком, что мы должны быть в реестре МСП, но нас там нет - будет отправлено в НО по месту нахождения. А уж они будут разбираться почему ЮЛ нет в реестре (у них есть вся инфа с данными о том, почему ЮЛ не в реестре).
Если причины первые 3-и - они должны обратиться в РО, чтобы они разобрались что не так с ЕГРЮЛ. Если последние 2-е, то они должны разобраться что не так с отчетностью, и, если она есть, но не была поднята на ФУ - переподнять ее.
Ну или ответить - почему ЮЛ в реестр не будет включено.