Добрый день! Вам проще переделать договор на площадь, какую просит Росреестр, и сдать как дополнительные документы.
На всякий случай закажите выписку сами через портал кадастровой палаты (не Росреестра!), сравните площадь.
В крайнем случае, напишите обращение на сайте "Ваш контроль", там очень...