Если р/с нет, и з/п не начисляется, то расклад такой
Условные обозначения: Г - голова, Ф - филиал
НДС: уплата/отчетность - Г
Налог на прибыль: уплата - фед.бюджет - Г, рег.бюджет - Г/Ф
отчетность - Г (с указанием доли)
Налог на имущество: в зависимости от того, на чьем балансе имущество и есть ли недвижимость
ЕСН: уплата/отчетность - Г
пенс.взносы: уплата/отчетность - Г
несч.сл.: уплата/отчетность - Г
НДФЛ:
уплата - Г/Ф
(отдельными платежными поручениями по разным ОКАТО:
с доходов работников Г - по месту нах. Г,
с доходов работников Ф - по месту нах. Ф)
отчетность (2-НДФЛ) - Г
(с указанием ОКАТО, по которому перечисляется налог)
(спорный вопрос, можно страктовать и как разделение на Г и Ф)
Акцизов, надеюсь, нет