С этим вопросом разобрался. Об этом сказано в Письме ФНС РФ от 30.12.2010 № ПА-37-6/19020@.
Теперь возник следующий - по каким реквизитам оплачивать госпошлину, по реквизитам 46 налоговой, для получения в любой другой в Москве, или по реквизитам той налоговой, в которой зарегистрирована организация о которой получаем сведения?