Что -то вы нас совсем запутали. Заказчик ваш оплачивает не по сч фактуре , а по инвойсу ваши услуги. Я выставляю инвойсы на англ языке клиенту. Потом акт на англ языке , они его подписывают. Контракт на англ. и русском, если сделка свыше 50 000 дол.
Им счет фактура не нужна. Она нужна вам, если вы оказываете услуги на территории России, то НДС платите в общем порядке, т.е выставляете счт факт.
И потом еще следуют ряд действий по списанию с транзитного счета валюты. Вообще вы первый раз с валютой работаете? Есть законодательство валютное, его надо изучать.