Добрый день. А срок в 3 года откуда взяли, если не секрет?!
Сроки хранения бухгалтерских и налоговых документов, порядок их уничтожения и ответственность за нарушение хранения и уничтожения закреплены законодательно. Основные правила прописаны в НК РФ, приказе Министерства культуры РФ от 25.08.2010 № 558 и двух федеральных законах. Это законы от 22.10.2004 № 125-ФЗ «Об архивном деле в Российской Федерации» и от 06.12.2011 № 402-ФЗ «О бухгалтерском учете».
Так как в вопросе акцент сделан именно на бухгалтерские документы, то даже обычная бухгалтерская справка должна храниться 5 лет, а отчетности и аудиторские заключения вообще до закрытия НКО.
Если налоговая отчетность у вас нулевая, то ИФНС вы не интересны и ковыряться в первичке никто не будет, если конечно у них не будет подозрения, что некоммерческой деятельностью подменяется коммерческая, то врядли придут штрафовать. А вот по поводу Минюста ничего не могу сказать. Ну и банки могут запрячь если какой то подозрительный платеж от физлица придет , в НКО ведь много оснований для приема денег от населения: взносы, спонсорство, помощь, благотворительность, ошибочно переведенная или с неверной формулировкой (где прямо напрашивается коммерческая деятельность и применение кассы онлайн).
Репутация НКО должна быть незапятнанной.
Задавая вопрос ориентировался на:
<Письмо> ФНС России от 25.07.2013 N АС-4-2/13622 (с изм. от 15.01.2019) "О рекомендациях по проведению выездных налоговых проверок"
1.3.2. Ограничения по проверяемому периоду.
Период, за который проводится проверка, должен состоять из целого числа налоговых периодов по всем налогам, сборам, по которым назначена проверка. При этом выездная налоговая проверка может быть назначена не ранее наступления сроков представления налоговых деклараций за последний налоговый период по всем налогам, по которым назначена проверка.
При проведении проверки по нескольким или всем налогам и сборам (независимо от формулировки предмета проверки) рекомендуется устанавливать единый период, за который проводится проверка, при этом может не совпадать период по проверкам правомерности заявленных к возмещению сумм налогов, перечисления налоговыми агентами налогов в бюджет.
В рамках выездной налоговой проверки может быть проверен период, не превышающий трех календарных лет, предшествующих году, в котором вынесено решение о проведении проверки (глубина выездной налоговой проверки) (абзац второй пункта 4 статьи 89 Кодекса).
Остальное, как понял из Вашего ответа, незаконно, но безболезненно (в нашем конкретном случае, для нашей организации).
