На мой взгляд, лучше возложить обязанности главного бухгалтера на руководителя с формулировкой "в связи с отсутствием в штате главного бухгалтера", а с бухгалтером заключить волонтёрский договор о консультировании по бухгалтерскому и налоговому учету и пр., так как согласно ч. 3 ст. 7 Федерального закона от 06.12.2011 N 402-ФЗ "О бухгалтерском учете" ответственным за учет и за хранение бухгалтерских документов является руководитель организации и он обязан, получается, возложить ведение учета на главного бухгалтера или иное должностное лицо, либо заключить договор об оказании услуг по ведению бухучета, т.е. не безвозмездно.