Так, давайте подведем итоги без лишних данных:
1) В ЕГРП - строение 2; в БТИ - сооружение 2. Так?
2) Ежели собственник и там, и там зафиксирован надлежащий, то почему бы просто не "подправить данные" либо в БТИ, либо в ФРС, дабы привести адрес к единообразию.
Конечно надо оставлять строение, потому что сооружения носят технический характер, в них нельзя не только жить, но и по определению нельзя использовать в качестве производственного помещения, офиса и т.п.
МосгорБТИ ведет адресный реестр объектов города Москвы, т.е. присваивает объектам адреса и ведет их по жизни. Адресный реестр представлен в виде базы. Ею в режиме он-лайн руководствуется ФНС при формировании базы ЕГРЮЛ, в том числе 46-я. Но реестр ЕГРП ФРС главнее (федеральное законодательство против регионального, а адрес по сравнению с правом собственности - вторичный признак объекта недвижимости) чем адресный реестр МосгорБТИ. Однако в ИФНС нет доступа он-лайн к ЕГРП. Возникает определенный сюжет когда Вы пойдете регистрировать юр. лицо на этом адресе, например (отказ). Выхода три: договориться с БТИ чтобы внесли изменения на основании сведений ФРС (маловероятно), обратиться в суд в случае получения официального отказа БТИ (судебная практика в Москве по этим вопросам весьма противоречива), либо наиболее реальный вариант - обратиться в Ростехинвентаризацию - Федеральное БТИ. (Могу оказать консультационное содействие).