ДА!
Изменения приобретают силу с момента их государственной регистрации, поэтому нет основания для отказа из-за изменения наименования самого ООО и должности его ЕИО.
ps. Хотя припоминаю одно сообщение здесь то ли в прошлом году, то ли в позапрошлом, что кому-то отказали из-за того что должность не соответствовала. Чем закончилось не помню.
У меня проходило без проблем.