В моей практике за последние 3-4 года не было отказов в случаях, когда прицеплял только договоры, подписанные в формате ЭДО (без полного пакета документооборота с xml и сигнатурами подписей)
Мск, МО, Самара, Рязань, НиНо, Томь, ещё где-то было.
Тут у Вас не в формате документов риск в первую очередь, а в том, что это второй этап при межрегиональной миграции - нужно быть уверенным что регион принимает и в том, что с вашим адресом всё Ok - в СПб хоть директора арендодателя и арендатора на пару налоговикам в зубах принесут нотариальный договор аренды, всё равно отказ после приостановки получишь с вероятностью, близкой к 100%.