Работать можно, но если на это ЗАО вы строите долгие (10 лет и более) планы и не хотите проблем на ровном месте (контроль за АОшками со стороны ФСФР постепенно нарастает), то зарегистрируйте акции либо преобразуйтесь в ООО
В любом случае, на отношениях с ИФНС отсутствие или наличие такой регистрации в 99,9999 % аналогичных случаях не сказывается.