Вот что в Консультанте нашла:
В новой редакции ст. 119 НК РФ база для расчета размера штрафа определена однозначно - это неуплаченная сумма налога. В ситуации же, когда налог уплачен своевременно, а декларация подана с опозданием, неуплаченной суммы нет. Следовательно, база для расчета штрафа равна нулю. Поэтому штраф за несвоевременное представление декларации в данном случае составляет 0 руб.
Таким образом, если налог уплачен налогоплательщиком своевременно и полностью, то взыскание даже минимального штрафа за задержку декларации представляется неправомерным. Однако время покажет, как будет складываться судебная практика.