пошлины по 35 т.р. платятся : Первый раз за регистрацию решения о выпуске ценных бумаг создаваемого АО (плательщик преобразуемое ООО) это все к моменту подачи документов в ГУ ЦБ на рег-цию акций АО и естественно задолго до подачи документов в налоговую на регистрацию АО
Второй раз уже после рег-ции в налоговой Ао эти 35 т.р. гос. пошлина за рег-цию отчета об итогах выпуска акций созданного в рез-те реорганизации АО и платит ее уже новое т.е. созданное АО со своего счета
Т.е. отчет и решение о выпуске тут в данном случае в отличи от случая при обычном учреждении АО не в результате реорганизации регистрируются не вместе а по очереди и последовательно и пошлина также платится по очереди и последовательно
Если все действия происходят в Москве то пошлины платят на реквизиты ГУ ЦБ по Москве (ну если конечно вы не в спец. списке ЦБ как особо важное ООО производящее особо важную продукцию что почти невероятно, или если у вас не гигантский уст. капитал в создаваемом АО от 5 млрд. руб кажется) т.е. как правило если адрес Москва или Московская обл. то обращаемся в ГУ ЦБ по Москве на ул. Балчуг. Точнейшее название этого органа уточнить с сайта ЦБ
вот отсюда все реквизиты и КБК по гос. пошлине в ГУ ЦБ
http://www.cbr.ru/finmarkets/?PrtId=common_stamp_duty&pid=issue&sid=ITM_9524