Хм, не очень понятно, как можно "выдать с эл.подписью"... Или Вы имеете в виду, что налоговая направила документы в контейнере на Вашу электронную почту?
Если так - то да, Лист о постановке на учет приходит без каких-либо отметок (в том числе без штампика "Подписан электронной подписью" с ФИО чиновника) и именно в таком виде переводится на бумагу (посредством такого нотариального действия, как заверение тождественности документа на бумажном носителе его электронному варианту). Разумеется, сам документ при этом должен быть подписан ЭЦП, которая сохраняется отдельным файлом в формате *p7s.