Все так.
документы подаете сначала в ГРП потом в налоговую, только в москве это МИФНС №47 (филиалы и представительсва в ней), далее фонды, (имейте ввиду что ФСС штрафует за несоблюдение сроков постановки на учет, остальные нормально)
на кайманах от налоговой нужен только сертификат Tax exemption, там никаких телодвижений связанных с открытием филиала в Москве проводить не надо.