Действующее законодательство не содержит требования к цене продажи доли участника общества. Стороны действуют в своем интересе (п. 2 ст. 1 ГК РФ) и могут определять любую цену продажи. Участник общества вправе самостоятельно определить цену продажи доли в уставном капитале общества. То есть, доля может быть продана как по номинальной стоимости, определенной в уставе, так и по рыночной цене, установленной по соглашению сторон.
Если покупателем доли является юридическое лицо, то указанное лицо признается налоговым агентом. Согласно п. 4 ст. 226 НК РФ налоговые агенты обязаны удержать начисленную сумму налога непосредственно из доходов налогоплательщика при их фактической выплате. У налогоплательщика обязанность по представлению налоговой декларации, исчислению и уплате налога не возникает.
Что касается признания за организацией-покупателем статуса налогового агента, существует альтернативное мнение по поводу необходимости удержания НДФЛ из доходов физического лица при продаже доли в ООО. Так, имеются судебные решения в пользу того, что организация в данном случае налоговым агентом не является. Например, ФАС Северо-Кавказского округа в постановлениях от 20.01.04 г. N Ф08-5406/2003-2085А, от 1.02.05 г. № Ф08-59/2005-3А указал, что формулировка п.п. 1 п. 1 ст. 220 НК РФ позволяет отнести к имуществу также и имущественные права. Следовательно, при продаже доли в уставном капитале применяется норма п.п. 2 п. 1 ст. 228 НК РФ о самостоятельной уплате физическим лицом НДФЛ при продаже имущества (см. также постановление ФАС Центрального округа от 2.10.07 г. № А54-363/2007С5).
В соответствии со ст. 210 НК РФ налоговая база по НДФЛ определяется исходя из всех доходов налогоплательщика, полученных им как в денежной, так и в натуральной формах, или право на распоряжение которыми у него возникло, а также доходов в виде материальной выгоды.
Таким образом, физическое лицо (продавец доли) обязано уплатить НДФЛ по ставке 13% со всей суммы, полученной от продажи доли в уставном капитале общества, вне зависимости от разницы между этой суммой и оценкой стоимости доли, определенной исходя из величины уставного капитала, стоимости активов общества или каким-либо иным образом.
Если покупателем доли выступает физическое лицо, то в данном случае уплата НДФЛ осуществляется участником общества самостоятельно. Продавец обязан самостоятельно подать декларацию в соответствии с п.п. 4 п. 1 и п. 2 ст. 228 НК РФ вне зависимости от того, возникла ли реальная обязанность уплатить налог в бюджет, или ее не возникло (вследствие применения налогового вычета в размере полной суммы полученного дохода).