В Москве проверка проходит как правило в форме сверки расчетов, т.е. приходит организации уведомление, что в связи с реорганизацией в форме присоединения просим явиться в территориалку и провести сверку расчетов, смотрят, должны ли вы и сколько при уходе из Москвы. На этом как правило и заканчивается все, если у вас нет существенных задолженностей. Если брать Московскую область и иные регионы, то выездная налоговая проверка в связи с реорганизацией существенно вырастает, но тоже не стопроцентно. У меня в области в 2009 году 2 организации-таки прошли все круги ада выездной налоговой проверки, участвовал в этом лично, скажу так, ничего приятного, одни оскорбления и нарушения от налоговиков. Как следствие крупные доначисления, а потом успев вовремя присоединиться, пошли от нас письма в УФНС о том, что все претензии к правопреемнику, хотя решение об уплате и сама проверка закончились ранее присоединения. По одной организации пришлось идти в арбитражку. Если брать итог, то территориалка сдулась, как только ее послали далеко в регион и показали доки, а УФНС по первой, и арбитражка + административка (там штрафы еще были) по второй согласились с нами. Как ни странно, но самым страшным врагом для нас оказался пенсионник. Дело дошло до прокуратуры, т.к. взносы не проводились, но там к счастью нашлись адекватные люди и после уплаты недостающих копеек, хотя гена был уже и не гена, фонд и прокуратура от нас отстали. Самое главное, это то, что конечного гену правопреемника пытались вызвать только единожды, но не найдя его на просторах нашей Родины, объявили в розыск, а дело наше осталось правым.