В соотв с ФЗ об ООО, и нал кодекс тоже имеет нормы похожие (там где сдача отчётнсоти и доверенность).
ООО должно иметь печать.
Ни одного НПА (т.е. обязательного акта гос. органа относящегося ко всем) обязывающего регистрировать где бы то не было печать нет.
Раньше было московское законодательство обязывающего регить печать в рег палате, сейчас судя по коменту гаранта орган на который была возложена эта функция не сущ, и вроде само постановл отменено.
Номерок, это скоре всего ОГРН, может ещё и инн плюс наименование с орг прав формой.
Я специально искал НПА обязывающие как то хранить особым образом, или отв-ть за не правильное хранение печати, нашел только что касается печатей нотариусов гос орг. т.е. содержащих гос. символику.