Можно сдать нулевку (если для организации это не очень вылезает за рамки ранее сдаваемых) или с данными, по которым будет штраф, приемлемый для организации по размерам.
Затем подать уточненку уже с нужными суммами.
В этом случае только надо имет в виду следующее письмо совместное письмо Минфина и МНС от 01.04.2009 г. № ШС-22-7/240@: если уточненная декларация подана до окончания срока проведения камеральной проверки по первоначальной декларации, поданной после окончания срока для подачи декларации, штраф начисляется, исходя из уточненной декларации.