На практике нал. органы анализируют и выявляют не только сам по себе факт "оформления" компании на "подставного" руководителя, а хотя бы "поверхностно" оценивают структуру бухгалтерской и налоговой отчетности, сопоставляют с финансово-хозяйственной деятельностью организации.
При наличии признаков налогового правонарушения/преступления могут конечно привлечь к налоговой ответственности, или передать материалы в "компетентные органы".
Но соответственно, и вариант переоформления таких компаний "на себя" во многих ситуациях возможен, а иногда и просто необходим (например в случае наличия долгосрочных договоров с "серьёзными" контрагентами). Или когда на такой компании "зависает" слишком серьезная сумма.
Добавлено через 3 минуты 35 секунд
В данном (описываемом мною) случае, мы сами "просим" правоохранительные органы "помочь" нам найти "нашего" ЕИО, т.к. по прописке Он не проживает - и друзья/знакомые его давно не видели.