ТЕОРИЯ.
1. Налоговая может инициировать проверку в отношении банкротящегося предприятия, в том числе и выездную.
2. Согласно пунктов 6 Протокола № 1 к Соглашению о взаимодействии между Следственным комитетом РФ и ФНС от 13.02.2012 г. № 101-162-12/ММВ-27-2/3 (внимание, СААУ) налоговики могут направить материалы в Следственный комитет не только на основании Решения о привлечении к ответственности, но и
"при выявлении обстоятельств, позволяющих предполагать совершение нарушения законодательства о налогах и сборах".
В этом случае налоговики направляют в СК копии документов на основании которых возможно предположить наличие в действиях должностных лиц организации уголовно наказуемых нарушений законодательства о налогах и сборах, копии приказов о назначении на должность лиц, ответственных за финансово-хозяйственную деятельность, копии объяснений должностных лиц организации, справка о том за какие проверяемые периоды и в каких размерах выявлено сокрытие денежных средств, либо имущества. В случае дополнительной информации направляют и ее.
Материалы в Следственный комитет направляются сопроводительным письмом за подписью руководителя, или зама налогового органа.
В, принципе, налоговики предварительно могут направить обращение об предварительном ознакомлении уполномоченного лица следственного комитета с материалами о нарушениях законодательства о налогах и сборах и уже по результатам предварительного ознакомления может приниматься решение о направлении материала в СК.
ПРАКТИКА
Следует учитывать что все вышеперечисленное связанное с уголовкой вещь геморройная и идет через начальство налогового органа и следственного комитета. По пустякам и рядовым налогоплательщикам никто заморачиваться не будет.
Имейте в виду, что в налоговых инспекциях Москвы числятся по 25 - 50 тыс. юр. лиц (Регфорум не зря работает

) в каждой. Из них сдают отчетность процентов 50. На остальных махнули рукой. Вы из этих десятков тысяч в Вашей инспекции на которых махнули рукой самые крутые что ли?
Имейте в виду, что если у Вашей организации на момент банкротства показана (в реестре кредиторов) уже задолженность перед бюджетом (это Ваш большой юридический косяк если Вы включили задолженность перед бюджетом в реестр кредиторов) и она свыше 1 млн. руб. принятие решения по Вашей организации будет идти через УФНС.
И самая основная, супер главная (мы ж в России живем) тема для принятия решения налоговым органом по Вашей несчастной, бедной-пребедной организации-банкроту. Орган (в лице своих прекрасных дам) прекрасно понимает, что взыскать задолженность (поиметь) с банкрота нереально.
И при этом, если официально, в процессе банкротства, ИФНС насчитает Вашей организации безнадежную задолженность перед бюджетом у нее БУДУТ УХУДШАТСЯ ПОКАЗАТЕЛИ. За плохие показатели УФНС будет долбить ИФНС. ОНО ЭТО (Вас гнобить) ИНСПЕКЦИИ НАДО?!
Поэтому не переживайте и идете пить Ром.