Конечно несут - перед клиентом. А перед налоговым органом всю ответственность несет единоличный исполнительный орган.

Ну если бы сотрудники бухгалтерских фирм за все декларации ответственность несли – вообще бы на допросах целыми днями сидели. Единичный случай, поражающий наглостью некоторых сотрудников некоего налогового органа. Ведь наверняка не было аргументировано ни одного обвинения, они сослались хоть на один нормативно-правовой акт? Все "претензии" налоговых обычно заканчиваются, когда просиш...