Кто-нибудь реорганизовывался в 2017? Как со справками из пфр ввиду того что пфр передала данные в налоговую?

Если вкратце - да, налоговую надо уведомлять. Необходимо принять решение об отмене ранее принятого решения и подать форму 12003 с отметкой 2.

ИФНС вносит только часть данных. Посмотрите табличку столбец "Субъект".Лично моё мнение по поводу ЕФРС - задумка когда-то была хорошая, но реализовали её так себе. А по резузльатут тендера ведёт ЕФРС - Интерфакс. Можно сделать выводы что к чему.