Лист Л заявления "Сведения об управляющей организации" заполняется в случае изменений сведений об управляющей организации юридического лица.7.16.1. В разделе 1 "Причина внесения сведений" в поле, состоящем из одного знакоместа, проставляется соответствующее цифровое значение.Если проставлено значение 2, заполняются соответствующие разделы - 2 - 4.

паспортные данные зачем ? по 129-ФЗ 14 форму можно сдать и без протокола

договор сдавали со старым наименованием ?

галочку ставите только если с 312-ФЗ приводите, если с 99-ФЗ, то не ставите

сейчас срок давности по 14.25 один год. Скорее всего приехала проверка в ИФНС, вот они и поднимаю все косячные дела.

если в Уставе прописан адре: г. СПБ, т.е. Устав приведён в соответствие с 99-ФЗ, можно сдать 14 форму и Копию дог.субаренды+ свидетельство с согласим  Арендодателя. Если адрес полный, с улицей и № дома, то по 13 + все документы

да, пройдёт. И 14 и 13 надо подавать в МРМ № 15, а спустя 20 дней, на смену адреса уже в МРИ № 46

да, сдаёте документы в 1 этап в МРИ № 46

можно указать адрес любого ФЛ, собственника адреса, главное что бы когда ИФНС будет выходить на адрес, обзванивать или смотреть по базе, стобы ФЛ был собственником адреса. Ещё вакриант, после подачи заявления и документов, самим прийти в ИФНС, в отдел оперативного контроля, и заявить что Вы не возражаете против регистрации. 

ИФНС № 3 по просьбе МРПИ ФНС № 46 опросила собственника адреса, который отказался от Вас, сказав что помещение по заявленному адресу не предоставлялось создаваемому юр лицу в качестве местоннахождения.