Потому что, когда происходит Ликвидация, то есть установленный порядок. А когда исключение из ЕГРЮЛ - юр. лицо исключают в одностороннем порядке. Суть одна, порядок разный. Арбитражный суд, потому что это Экономическая сфера
по идеи да, но деньги находятся на счету недееспособного юр. лица, поэтому маловероятно, что банк разрешит их снять вам. Если банк откажется, то через арбитражный суд и ст. 12 ГК РФ.
Если у организации нет активов за счет которых долг перед бюджетом можно возместить, то сам долг перед бюджетом не помешает исключению юр. лица из ЕГРЮЛ. Проверено на практике.