Действительно, программа не даёт заполнить 2 листа Л при смене управляющей компании (прекращение-возложение), мы всегда делаем этот вид изменений в экселе (при чем, такие изменения у нас бывают довольно часто) и в 100% случаев регистрация проходит успешно. Возможно Вам стоит перепроверить правильность заполнения форм. И уж точно налоговая не имеет право не принять форму в экселе.

Для Питерской 15 МИФНС, это, к сожалению, обычная практика. У нас, в 46-ой МИФНС по г. Москве ни разу не давали отказов из-за отсутсвия пункта про приведение устава в соотв. с 99-фз. Мы его никогда и не прописывали.