С недавних (с октября 2014 года) пор Общества не могут сами вести реестр.  Лично мое мнение, что избавится от акционера, без его каких-либо действий не возможно, даже если и провести доп эмиссию, с минимальным % он все-равно останется.
Brainstorm. Акционер ушел по-английски, но по реестру акционеров продолжает владеть акциями Общества
У меня уже есть ответ ЦБ, который придерживается позиции, что заверять НЗК решения единственного акционера не требуется. 
Оспаривание разъяснения ФНС: коллективный иск
1