А причина, как мне пояснили в 10 МИФНС по Тульской области, в новом программном обеспечении. И что оно выгрузку на федеральный уровень делает совершенно произвольно, не учитывая многие изменения, внесенные в ЕГРЮЛ. У нас как всегда - хотели, как лучше, а получилось, как получилось.