Подавали по ЭЦП, тоже была приостановка (налоговая засомневалась в нашем адресе), но все прошли отлично.

Именно так, для проведения подобной реформы сначала надо побороть "зарплаты в конвертах".

В ИП, порой, лезут не для ведения бизнеса, а для оптимизации налогообложения.

Не стоит.

Кстати, по моим наблюдениям, в https://egrul.nalog.ru/ данные появляются, порой, даже раньше, чем на https://service.nalog.ru/uwsfind.do

В конце февраля подавались на первый этап ликвидации с недостоверным адресом, отказа не было. Видимо, мы успели в двери уходящего поезда.

Вам очень сильно повезло. Подтверждаю написанное выше, у меня в программе можно заполнить "Мытищи г, Вешки п, Абрикосовая ул...". Я бы так и подавал. В аналогичной ситуации (один город Московской области присоединился к другому) подавал так, как давала заполнить программа, и никакого экселя. Штамп в паспорте, несмотря на то, что там указан несуществующий город, не меняли.

Судя по описанию, идеальная работа для трудоголиков-альтруистов.

Устаревшие сведения о внутренней планировке помещений?

Адрес "до здания". И для уточнения точности указания "юридических" адресов, и для уточнения точного адреса постоянной регистрации учредителей/генерального директора.