А вот в письме Минфина от 21.06.2013 № 03-04-05/23404 прямо говорится, что ООО - налоговый агент, однако обратите внимание на последний абзац письма
Департамент налоговой и таможенно-тарифной политики рассмотрел письмо по вопросу обложения НДФЛ доходов в виде ДСД в УК ООО, выплачиваемых при выходе участника из ООО, и сообщает.
Согласно пункту 6.1 статьи 23 ФЗ от 08.02.1998 N 14-ФЗ "Об ООО" в случае выхода участника ООО из ООО в соответствии со статьей 26 указанного ФЗ его доля переходит к ООО. ООО обязано выплатить участнику ООО, подавшему заявление о выходе из ООО, ДСД в УК ООО, определяемую на основании данных бухотчетности ООО за последний отчетный период, предшествующий дню подачи заявления о выходе из ООО, или с согласия этого участника ООО выдать ему в натуре имущество такой же стоимости либо в случае неполной оплаты им доли в УК ООО действительную стоимость оплаченной части доли.
Статьей 210 НК установлено, что при определении налоговой базы по НДФЛ учитываются все доходы налогоплательщика, полученные им как в денежной, так и в натуральной формах, или право на распоряжение которыми у него возникло, а также доходы в виде материальной выгоды, определяемой в соответствии со статьей 212 НК.
Таким образом, при выходе участника из ООО выплаченная ему ДСД подлежит обложению НДФЛ на общих основаниях с полной суммы выплаченного дохода.
В соответствии с пунктами 1 и 2 статьи 226 НК организации РФ, от кот. или в результате отношений с которыми налогоплательщик получил доходы, за исключением доходов, в отношении кот. исчисление и уплата налога осуществляются в соответствии со статьями 214.1, 214.3, 214.4, 214.5, 227, 227.1 и 228 Кодекса, обязаны исчислить, удержать у налогоплательщика и уплатить сумму налога, исчисленную в соответствии со статьей 224 Кодекса. Указанные организации являются налоговыми агентами.
Поскольку доход налогоплательщика в виде ДСД, полученный при его выходе из общества, не относится к доходам, предусмотренным указанными статьями Кодекса, в отношении таких доходов налогоплательщика организация является налоговым агентом и обязана исчислить, удержать у налогоплательщика и уплатить сумму НДФЛ в общеустановленном порядке с полной суммы выплаченного дохода, а также представить соответствующие сведения в налоговый орган.
В том случае, если подлежащая уплате сумма налога не была удержана налоговым агентом, исчисление и уплата налога производятся налогоплательщиком самостоятельно в соответствии с положениями статьи 228 Кодекса на основании налоговой декларации, представляемой в налоговый орган по окончании налогового периода, в котором был получен доход.
При этом в соответствии с подпунктом 2 пункта 1 статьи 223 Кодекса при получении доходов в натуральной форме датой фактического получения дохода признается день передачи доходов в натуральной форме.
Одновременно сообщаем, что в соответствии с пунктом 11.4 Регламента Министерства финансов Российской Федерации, утвержденного приказом Министерства финансов Российской Федерации от 15.06.2012 N 82н, в Министерстве финансов Российской Федерации не рассматриваются обращения по оценке конкретных хозяйственных ситуаций.