-обратитесь к адвокату.
-когда в "органах" будут брать показания и вы их будете подписывать, очень внимательно читайте и если будут двусмысленные или неточные фразы ВСЕГДА уточняйте (возможно протокол на 5-6 листах, это все прикрытие получить "нужные" ему показания в двух словах)
-брать объяснения со свидетелей бесполезно, их все равно не приобщат, а вот собрать данные свидетелей и ходатайствовать о их вызове это ваше право, а обязанность "органов" их вызвать.
-найдите должностную обязанность, инструкцию исполнительного директора выучите назубок, подписывали вы ее, договор о материальной ответственности был?
-Что вам передали по акту приему передачи и что есть на самом деле есть.
-Ну и вспомните все документы какие подписывали.
- Говорить "органам" все очень неосторожно, лучше посоветуйтесь с адвокатом, возможно в ваших действиях были какие то правонарушения.