1. Достаточно одной формы, все верно. Галку ставят, в соответствии с п. 5.3 Требований, только при приведении в соответствие с ФЗ-312. В протоколе укажите что устав приводите в соответствие с ФЗ-99. 2. Адрес регистрации ген. директора по-хорошему должна сообщать ФМС (ст. 5 ФЗ №129), однако можете и сами сообщить, поскольку бывает, что те не сообщают.