Что-то мне кажется налоговая не права. В оговоренных изменениях не содержится конкретно слов "первичной регистрации". Там только "государственной регистрации" и отсылка на приказ, которым были утверждены формы заявлений. Отсылка с оговоркой, что заявителем были допущены ошибки в форме, утвержденной приказом ФНС 2016 г.Обжаловать будете или еще не решили?