Кстати, шутки-шутками, но я, похоже, нашёл рабочий workaround для сложившейся ситуации.
Изменения в Устав, устанавливающие альтернативный способ принятия решения, можно внести протоколом ОСУ посредством заочного голосования. В статье 67.1. ГК России применительно к утверждению альтернативного способа подтверждения решений ОСУ ООО есть только требования в отношении количества голосов (единогласно), но не по форме решения. Сама же статья с 01 октября была изменена и применяется теперь только к очному голосованию.
Утверждение Устава (и внесение в него изменений) в список вопросов, по которым запрещено проводить собрания заочно (опросным путем), не входит. Равно как и утверждение такого способа отдельным решением участников (и вот тут ФНП, получается, ошибается - с 01 октября 2019 года я более не обязан свидетельствовать факт принятия решений и состав участников, если собрание проводилось заочно). А ошиблась ФНП потому, что комментировала Обзор Верховного суда. Который воспроизвел статью в редакции на дату спора, т.е. полуторагодичной давности.