Здравствуйте, ЮЮ79.
В п.3.1 ст.53 ФЗ об ООО, указано какие доли подлежат погашению при присоединении.
По идее, при реорганизации в форме присоединения, уставные капиталы присоединяемых обществ и основного общества суммируются. Поэтому, если доля ООО "С" в уставном капитале ООО "А" погасится, у Вас есть размер уставного капитала ООО "С", который суммируется с уставным капиталом ООО "А".
В моей практике, при присоединении, у меня гасилась доля основного общества в своем уставном капитале. Возникали похожие вопросы. Писал запросы в налоговую. Общий смысл ответа: при реорганизации, в случае уменьшения УК, параллельно проводить процедуру уменьшения УК не нужно, так как Вы проводите реорганизацию общества, а не уменьшение его УК.
В протоколе можете указать, что в результате присоединения размер уставного капитала составит ____________руб. ( не уменьшится, не уменьшается, а именно составит, чтобы никого не вводить в заблуждение).
Если возникают вопросы, можно "помучить" специалистов из центрального аппарата ФНС, позвонив по телефону и выбрав соответствующую категорию вопросов. Если они окажутся в затруднении, они смогут переключить на 46-ю.