На самом деле в п. 6 ст. 24 Закона об ООО говорится, что общество (соответственно, в лице руководителя) извещает регорган только в том случае, если в течение месяца после перехода к Обществу доля была распределена, продана или погашена. А вот если она не была в течение месяца после перехода к Обществу распределена продана или погашена, то не написано, что извещает регорган само общество. Согласен с Вами, что вышедший участник уже не может, не будучи участником, извещать регорган о том, что его доля перешла к Обществу, указывая в заявлении по 14-ой форме себя в качестве участника. И, видимо, это должен сделать именно руководитель даже несмотря на то, что в законе прямым текстом об этом не написано.
Но, кстати, в законе есть и еще один момент, о котором никто не сказал, в соответствии с которым заявителем может быть либо сам участник, либо Общество. Речь идет о п.2 ст. 23 Закона об ООО. В частности о частичном выходе из Общества участника по письменному требованию. Участник направляет Обществу требование выкупить у него часть доли, продать или иным образом уступить которую ему запретили остальные участники или Общество на основании Устава. Соответственно, в данном случае, если будет регистрироваться только передача части доли Обществу, то заявитель будет однозначно участник Общества (в соответствии с законом о госрегистрации и на том основании, что даже отчуждая часть доли он остается участником ООО), а вот если в течении месяца эту долю Общество куда-нибудь денет (распределит, продаст или погасит), то в соответствии с п. 6 ст. 24 Закона об ООО заявителем уже однозначно будет руководитель… Так что вот такая вот заморочка получается...
Т.е. в конченом итоге зависит от того, полностью доля или ее часть будет передаваться Обществу и будет ли эта доля или ее часть в течении месяца после перехода к Обществу комунибудь распределяться продаваться и т.п..