К нотариусу участники данного рынка услуг уже давно не ходят - всё прекрасно меняется по ЭЦП)
Самый простой вариант - написать письмо в регистрирующий орган от участника (участников) о запрете внесения изменений без нотариально удостоверенного решения. В Питере такие заявления МИ ФНС № 15 принимает и в одном известном мне случае действительно 3 раза подряд отказывали в смене руководителя. Но там был типичный корпоративный конфликт и о возможной подаче документов участники знали, поэтому сначала сходили на приём к руководству МИ ФНС № 15, после чего через канцелярию подали соответствующее заявление